透视真菌:从宏观到微观

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项目介绍

    1. 科学描述一个真菌物种:对具有典型特征的样品在体视镜下进行观察,分离获得单孢纯菌株,继而采用微分干涉显微镜和电镜进行微观形态特征的观察,获取高质量的显微图片,完成一个真菌物种的形态描述。

    2.生命树(系统进化树)的构建:如何准确鉴定病原微生物,服务于农、林和海关检验检疫部门的检测、防治和拦截是目前行业面临的重要关键问题之一。本项目主要通过提取微生物的基因组,获取 DNA 条形码序列,重建系统进化树,明确目标微生物的分类地位。

    3.次级代谢产物分析:完成一个真菌基因组的次级代谢产物生物合成基因的生物信息学分析及真菌次级代谢产物的分析分离鉴定方法。

    2. 基因组大数据分析:完成一个真菌的基因组测序及初步的生物信息学分析;或完成一份环境样品的宏基因组测序及生物信息学分析(包括 Linux 系统、R 语言与统计分析等)。

    项目特色

    (1)本项目涉及的知识面较广,如分离培养、形态观察、分子实验操作、次级代谢产物分析、基因组学预测等,因此对学生将是全方位的锻炼。

    (2)本项目涉及到比较基因组学理论和软件分析,能帮助学生在理论和实践方面做深度拓展与积累。

    (3)本项目与实际需求紧密结合,能够有效培养和提高学生运用所学知识解决实际问题的能力。

    招生对象和要求

    优秀高中生、大学本科生,微生物、植物保护、森林保护、天然产物化学、生物技术等相关专业,要求具备扎实的微生物或计算机编程基础。

    为了更好的完成科研项目,项目组会以笔试或面试的形式对学生进行筛选。


项目背景

    真菌作为自然界中的第二大生物类群,具有丰富的物种与遗传多样性,在生态系统的多样性维持、群落构建以及物质与能量循环过程中发挥重要的功能。本项目以真菌为研究对象,依次从其宏观生长发育、形态发生、次级代谢以及基因组角度认知真菌,完成一个真菌物种的认识和描述。通过生成可靠的图片和数据集,理解真菌的生长发育规律;利用多种软件和算法解密真菌次级代谢产物调控基因及生物合成基因。

    主要方向如下:(1)科学描述一个真菌物种的宏观微观特征;(2)生命树(系统进化树)的构建;(3)次级代谢产物的分析;(4)真菌基因组初步分析。

    此实习项目适合申请专业方向为微生物、植物保护、森林保护、天然产物化学、生物技术等相关专业的学生。学生将与相关领域专家一同探讨微生物的宏观微观形态特征、系统演化和基因组分析,以及 Linux 系统、R 语言数据分析等的相关研究和应用,且学生可通过该项目了解目前组学与生物信息学在微生物领域的应用现状和前景。

    实习结束后,导师会根据学生表现,出具推荐信。对于相当优秀的学生,会有进一步合作研究的机会。


项目日程


常见问题

  •    课题都可以安排线上吗?

    不是所有都可以的,例如理工科需要设备做实验,都是真实全天候在实验室跟着导师做科研,非常培训学生的学术思维和创新能力。除了理工科外,有些课程也开设了远程项目。

  •    线上大概是多久时间可以学完呢?

    具体看学生吸收情况,慢的一学期甚至更长,快的2-3个月。

  •    上课或者做科研都是几个学生一起呢?

    有1对1的,也有小班,人数比较少10人以下为主,根据需求定制。

  •    导师可以指导发表论文吗?具体如何操作呢?

    可以的,导师会根据学生的课题方向和学生沟通确定好题目,并指导论文如何开展,学生主操作书写论文后,导师审核后投稿,投稿后一般1个月左右拿到用稿通知。

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